Манаус: массовая реинфекция COVID-19, грозящая неэффективностью вакцин?

В апреле прошлого года Амазония была одним из наиболее пострадавших от COVID-19 регионов мира. Результаты исследования, опубликованного в сентябре в журнале «Science» и обновленные на прошлой неделе, свидетельствует, что более ³/₄ жителей по состоянию на октябрь уже сталкивались с вирусом (Buss L.F. et al., 2020)! Этого должно было быть достаточно, чтобы добиться группового иммунитета, препятствующего распространению вируса. Но, увы…

Болеют, несмотря на инфицирование весной?

Так, пик распространенности антител IgG к SARS-CoV-2 среди доноров в г. Манаус зафиксирован в июне с показателем (скорректированным по возрасту и полу), равным 52,5% (от 47,6% до 57,5%). Повышение серологической распространенности точно соответствовало кривой совокупной смертности. При этом распространенность тестирования низкая, так что многие доноры (в возрасте 18–60 лет) могли лишь предполагать о факте перенесенной инфекции. Столь же высокая серопревалентность (около 50%) была зафиксирована в трущобах Мумбаи (Индия) (Malani A., et al., 2020). С учетом установленной закономерности экспоненциального затухания серопозитивности авторы установили, что в октябре совокупная инфицированность населения Манауса (частота атак) составила 76,0% (95% доверительный интервал 66,6–97,9), хотя в отсутствие общепринятого подхода для учета серореверсии эти результаты следует интерпретировать с осторожностью (рисунок). До сих пор неизвестно, насколько долго сохраняется иммунитет против SARS-CoV-2, и какая часть ранее инфицированных может снова заразиться и передать вирус другим. При этом значительная часть населения — где-то — ¹/₄, как в Манаусе, где-то — ²/₃, как в Сан-Паоло на юго-востоке страны, остается интактной для вируса (Buss L.F., et al., 2020).

Рисунок

Оценки распространенности антител SARS-CoV-2 в Манаусе с рядом корректировок; красные точки — совокупная инфицированность населения; серые столбцы — стандартизованная дневная смертность с использованием подтвержденных случаев смерти вследствие COVID-19 из SIVEP-Gripe (covid.saude.gov.br); черная линия — кумулятивные летальные исходы (Buss L.F., et al., 2020)

А как же групповой иммунитет? В том то и дело, что максимальная распространенность антител к вирусу (около 50%) была зафиксирована только летом, впоследствии она снизилась. Люди, у которых антител в крови уже нет, могут переносить COVID-19 в легкой форме и заражать других. А поскольку уязвимых для вируса людей (в силу возраста и общего состояния здоровья) еще немало, коронавирусная болезнь имеет обильную «жатву». В то же время по причине относительной молодости популяции смертность вследствие инфекции оценивается в 0,17–0,28%, при этом общая смертность в Манаусе за 2020 г. в 4,5 раз выше, чем в предыдущие годы (Sridhar D., Gurdasani D., 2021). В группах населения с более высокой долей лиц пожилого возраста общий уровень смертности от инфекций будет выше, от 0,46% до 0,72%, как в Сан-Паулу.

Какие варианты избегают нейтрализации антителами?

Внимание исследователей в настоящее время поглощено вопросом: связана ли вторая волна с новой, «бразильской» версией Sars-CoV-2, который был выявлен в Манаусе в декабре? Может быть, защита от инфекции первой волны не помогает против «нового» мутировавшего вируса? Возможно, он не только передается легче, но и гораздо опаснее с клинической точки зрения и, к тому же, вакцинная защита в отношении него не является достаточной? Пока нет ни клинических, ни лабораторных данных, отвечающих на данные вопросы. Вариант P1 (происходящий от линии B.1.1.28) пока лишь изредка появлялся в глобально скоординированных базах данных, локализуясь в Бразилии, Японии и Италии. Однако среди образцов из Манауса с 15 по 23 декабря, о чем 12 января сообщила британо-бразильская геномная сеть «Cadde», 42% уже принадлежали к линии P1, хотя с марта по ноябрь подобных образцов не было (Faria N.R. et al., 2021).

Таким образом, вариант P1 из Манауса, вероятно, обладает свойством легко распространяться — подобно британскому B.1.1.7 (линия 501Y.V2 или VOC2020212/01) и южно-африканскому B.1.135 (линия 501Y.V2). Специалистов особенно беспокоит то, что мутации имеют общие генетические черты. Так, P1 содержит целый пакет из почти двух десятков мутаций, включая N501Y (также присутствует в британском и южно-африканском вариантах), имеющую решающее значение для вирулентности, и мутацию E484K (подобно B.1.135). Последняя, как предполагают, может обусловливать «ускользание» Sars-CoV-2 от иммунной защиты, в частности, гуморальной (Greaney A.J. et al., 2020).

Во всяком случае исследователи из Южной Африки уже предупреждают, что SARS-CoV-2 501Y.V2 (линия (B.1.351) реализовал полный уход от 3 классов терапевтически релевантных моноклональных антител. Более того, 501Y.V2 демонстрирует частичное или полное избегание нейтрализующих антител плазмы выздоравливающих от COVID-19 (Wibmer K., et al., 2021). Так, почти половина (21 из 44, 48%) проанализированных образцов не имела нейтрализующей активности против вируса 501Y.V2, и только в 3 образцах (7%) выявлены высокие титры нейтрализующих антител. Примечательно, что все эти 3 образца были получены от людей, сообщивших о тяжелом заболевании, у которых были одни из самых высоких титров нейтрализации исходного вируса.

Настороженность в отношении вакцинации и диагностики

Нарушенная в результате мутаций нейтрализующая способность антител, выработанных при инфекции более ранними вариантами вируса, может означать потенциальное снижение защитного эффекта вакцинации. В наибольшей степени, как показало картирование мутаций в рецептор-связывающем домене SARS-CoV-2, таким эффектом обладает мутация E484K, присутствующая в B.1.351, но отсутствующая в B.1.1.7.

Что касается возможностей диагностики, то многие производители тестовых наборов для полимеразной цепной реакции выступили с обнадеживающей информацией: аминокислотные последовательности большинства белков, используемых для анализа, у новых вариантов не претерпели существенных изменений и по-прежнему остаются доступными аналитическим системам. 8 января 2021 г. Управление по контролю за пищевыми продуктами и лекарственными средствами США (Food and Drug Administration — FDA) предупредило о потенциальных ложноотрицательных результатах, связанных с часто используемыми тестами на COVID-19, из-за мутаций в генетическом коде SARS-CoV-2. FDA выявлены 3 молекулярных теста, на эффективность которых могут повлиять указанные варианты SARS-CoV-2. Лаборатории, использующие один из этих анализов, должны действовать с особой осторожностью: анализы, выполненные с любым из этих тестов следует повторить при подозрении на ложноотрицательный результат.

Если новый вариант P1 вируса SARS-CoV-2 начал циркулировать в Амазонии с осени, то страны ЕС, возможно, за ближайшие 5–6 мес. успеют создать у себя «подушку безопасности» против массового распространения мутировавшего возбудителя. Положение сообществ, где к этому сроку пройдет, как и в Манаусе, полгода с момента массовой «волны» заболеваемости (там — с апреля по октябрь, у нас — с декабря по июнь), может оказаться намного хуже. Похоже, повторяющиеся циклы вакцинации через каждые 6–12 мес. — будущее, которое готовит нам COVID-19.

Список использованной литературы

1. Buss L.F., Prete C.A. et al. Three-quarters attack rate of SARS-CoV-2 in the Brazilian Amazon during a largely unmitigated epidemic. Science, 15 Jan 2021: 288–292.
2. Faria N. R., Claro I. M. et al. Genomic characterisation of an emergent SARS-CoV-2 lineage in Manaus: preliminary findings. Jan 13 2021, at virological.org/t/ genomic-characterisation-of-an-emergent-sars-cov-2-lineage-in-manaus-preliminary-findings/586.
3. Greaney A. J., Loes A. N. et al. Comprehensive mapping of mutations to the SARS-CoV-2 receptor-binding domain that affect recognition by polyclonal human serum antibodies. bioRxiv 2020.12.31.425021. doi: https://doi.org/10.1101/2020.12.31.425021.
4. Malani A., Shah D. et al. Seroprevalence of SARS-CoV-2 in slums versus non-slums in Mumbai, India. Lancet Glob. Health 10.1016/S2214-109X(20)30467-8 (2020).
5. Sridhar D., Gurdasani D. Herd immunity by infection is not an option. Science, 15 Jan 2021: 230-231
6. Wibmer K., Kurt C. et al. SARS-CoV-2 501Y.V2 escapes neutralization by South African COVID-19 donor plasma. January 19, 2021. doi: https://doi.org/10.1101/2021.01.18.427166.

Бажаєте завжди бути в курсі останніх новин фармацевтичної галузі?
Тоді підписуйтесь на «Щотижневик АПТЕКА» в соціальних мережах!